多发性硬化症和多系统萎缩区别是发病原因不同、症状不同、治疗方法不同。
1、发病原因不同：多发性硬化症是一种中枢神经系统，慢性炎症性脱髓鞘性疾病，可能是病毒感染、自身免疫反应、遗传因素以及环境因素等导致的。多系统萎缩是一种罕见的神经性病，可能是神经元本身变性失活以及原发性少突胶质细胞病变等因素导致的。
2、症状不同：多发性硬化症的患者经常会出现感觉异常、肢体无力、视力障碍、发作性症状等。多系统萎缩的患者早期会出现自主神经功能障碍，比如尿频、尿急、尿失禁、体位性低血压等，而且还会出现帕金森症状、小脑性共济失调等。
3、治疗方法不同：多发性硬化症在急性期需要在医生指导下使用醋酸氢化可的松片、甲泼尼龙片、醋酸地塞米松注射液等药物治疗。缓解期可以在医生指导下使用、西尼莫德片、特立氟胺片、奥法妥木单抗注射液等药物治疗。需要根据症状进行针对性治疗，对于体位性低血压的患者，需要在医生指导下服用盐酸米多君片，当患者出现泌尿肌痉挛的症状时，可以在医生指导下服用曲司氯铵片的药物治疗，同时还需要配合心理治疗和康复治疗。
